MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycoplasma conjunctivae HRC/581 chromosome

Total Repeats: 23801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012806	ATG	2	6	18058	18063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047149
502	NC_012806	AAAC	2	8	18181	18188	75 %	0 %	0 %	25 %	240047149
503	NC_012806	ATA	2	6	18221	18226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_012806	ATA	2	6	18319	18324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047150
505	NC_012806	CAAAAT	2	12	18390	18401	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	240047150
506	NC_012806	TTA	2	6	18407	18412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047150
507	NC_012806	AAG	2	6	18457	18462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047150
508	NC_012806	ATAAA	2	10	18463	18472	80 %	20 %	0 %	0 %	240047150
509	NC_012806	A	6	6	18640	18645	100 %	0 %	0 %	0 %	240047150
510	NC_012806	AAC	2	6	18662	18667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047150
511	NC_012806	ATT	2	6	18716	18721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047150
512	NC_012806	A	6	6	18753	18758	100 %	0 %	0 %	0 %	240047150
513	NC_012806	AT	4	8	18796	18803	50 %	50 %	0 %	0 %	240047150
514	NC_012806	TC	3	6	18872	18877	0 %	50 %	0 %	50 %	240047150
515	NC_012806	AT	3	6	18880	18885	50 %	50 %	0 %	0 %	240047150
516	NC_012806	CAA	2	6	18901	18906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047150
517	NC_012806	TAT	3	9	18912	18920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047150
518	NC_012806	A	6	6	18960	18965	100 %	0 %	0 %	0 %	240047150
519	NC_012806	TTC	2	6	19025	19030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047150
520	NC_012806	ATA	2	6	19093	19098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047150
521	NC_012806	GATA	2	8	19107	19114	50 %	25 %	25 %	0 %	240047150
522	NC_012806	ATA	2	6	19170	19175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047151
523	NC_012806	GCT	2	6	19208	19213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240047151
524	NC_012806	ATC	2	6	19234	19239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047151
525	NC_012806	A	7	7	19445	19451	100 %	0 %	0 %	0 %	240047151
526	NC_012806	CAA	2	6	19457	19462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047151
527	NC_012806	ATA	2	6	19521	19526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047151
528	NC_012806	A	6	6	19550	19555	100 %	0 %	0 %	0 %	240047151
529	NC_012806	A	6	6	19621	19626	100 %	0 %	0 %	0 %	240047151
530	NC_012806	GAA	3	9	19637	19645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047151
531	NC_012806	TA	3	6	19668	19673	50 %	50 %	0 %	0 %	240047151
532	NC_012806	TTGA	2	8	19769	19776	25 %	50 %	25 %	0 %	240047151
533	NC_012806	T	6	6	19845	19850	0 %	100 %	0 %	0 %	240047151
534	NC_012806	A	7	7	19862	19868	100 %	0 %	0 %	0 %	240047151
535	NC_012806	CTA	2	6	19878	19883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047151
536	NC_012806	CAC	2	6	19892	19897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240047151
537	NC_012806	GCT	2	6	19904	19909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240047151
538	NC_012806	GTA	2	6	19916	19921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047151
539	NC_012806	AGA	2	6	19951	19956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047151
540	NC_012806	A	6	6	19982	19987	100 %	0 %	0 %	0 %	240047151
541	NC_012806	A	6	6	20001	20006	100 %	0 %	0 %	0 %	240047151
542	NC_012806	AAG	2	6	20073	20078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047151
543	NC_012806	A	6	6	20093	20098	100 %	0 %	0 %	0 %	240047151
544	NC_012806	T	6	6	20112	20117	0 %	100 %	0 %	0 %	240047151
545	NC_012806	GAA	2	6	20177	20182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047151
546	NC_012806	TAG	2	6	20184	20189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047151
547	NC_012806	GAA	2	6	20195	20200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047151
548	NC_012806	TAA	2	6	20236	20241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047151
549	NC_012806	CTG	2	6	20256	20261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240047151
550	NC_012806	A	7	7	20290	20296	100 %	0 %	0 %	0 %	240047151
551	NC_012806	CAA	3	9	20318	20326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047151
552	NC_012806	GC	3	6	20339	20344	0 %	0 %	50 %	50 %	240047151
553	NC_012806	TAC	2	6	20367	20372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047151
554	NC_012806	AAG	3	9	20487	20495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047151
555	NC_012806	CAA	2	6	20543	20548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047151
556	NC_012806	A	6	6	20581	20586	100 %	0 %	0 %	0 %	240047151
557	NC_012806	T	6	6	20602	20607	0 %	100 %	0 %	0 %	240047151
558	NC_012806	ATTA	2	8	20680	20687	50 %	50 %	0 %	0 %	240047151
559	NC_012806	TAA	2	6	20707	20712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047151
560	NC_012806	CAA	2	6	20714	20719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047151
561	NC_012806	ATTT	2	8	20928	20935	25 %	75 %	0 %	0 %	240047151
562	NC_012806	AG	3	6	20950	20955	50 %	0 %	50 %	0 %	240047151
563	NC_012806	AATTT	2	10	20965	20974	40 %	60 %	0 %	0 %	240047152
564	NC_012806	A	6	6	21000	21005	100 %	0 %	0 %	0 %	240047152
565	NC_012806	GAA	2	6	21006	21011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047152
566	NC_012806	A	7	7	21034	21040	100 %	0 %	0 %	0 %	240047152
567	NC_012806	T	6	6	21057	21062	0 %	100 %	0 %	0 %	240047152
568	NC_012806	CTT	2	6	21064	21069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047152
569	NC_012806	AATC	2	8	21147	21154	50 %	25 %	0 %	25 %	240047152
570	NC_012806	TAA	2	6	21186	21191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047152
571	NC_012806	TTA	2	6	21281	21286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047152
572	NC_012806	TAA	2	6	21290	21295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047152
573	NC_012806	ATTT	2	8	21405	21412	25 %	75 %	0 %	0 %	240047152
574	NC_012806	GAT	2	6	21461	21466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047152
575	NC_012806	GAA	2	6	21476	21481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047152
576	NC_012806	T	6	6	21489	21494	0 %	100 %	0 %	0 %	240047152
577	NC_012806	GAA	2	6	21527	21532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047152
578	NC_012806	AAC	2	6	21558	21563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047152
579	NC_012806	TA	3	6	21590	21595	50 %	50 %	0 %	0 %	240047152
580	NC_012806	AGC	2	6	21597	21602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240047152
581	NC_012806	T	6	6	21634	21639	0 %	100 %	0 %	0 %	240047152
582	NC_012806	CTT	2	6	21675	21680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047152
583	NC_012806	AAT	2	6	21693	21698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047152
584	NC_012806	TTA	2	6	21775	21780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047152
585	NC_012806	TTTA	2	8	21781	21788	25 %	75 %	0 %	0 %	240047152
586	NC_012806	AG	3	6	21790	21795	50 %	0 %	50 %	0 %	240047152
587	NC_012806	TATT	2	8	21842	21849	25 %	75 %	0 %	0 %	240047152
588	NC_012806	TTG	2	6	21869	21874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047152
589	NC_012806	A	6	6	21877	21882	100 %	0 %	0 %	0 %	240047152
590	NC_012806	GAAA	2	8	21922	21929	75 %	0 %	25 %	0 %	240047152
591	NC_012806	A	7	7	21980	21986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_012806	ACA	2	6	22019	22024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_012806	T	6	6	22038	22043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_012806	TAT	2	6	22087	22092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_012806	CTTTC	2	10	22093	22102	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
596	NC_012806	GAA	2	6	22133	22138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047153
597	NC_012806	AGC	2	6	22204	22209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240047153
598	NC_012806	AAG	2	6	22212	22217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047153
599	NC_012806	GTG	2	6	22265	22270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240047153
600	NC_012806	TCT	2	6	22281	22286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047153
601	NC_012806	A	6	6	22316	22321	100 %	0 %	0 %	0 %	240047153
602	NC_012806	A	6	6	22331	22336	100 %	0 %	0 %	0 %	240047153
603	NC_012806	ATT	2	6	22384	22389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047153
604	NC_012806	TAC	2	6	22416	22421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047153
605	NC_012806	T	6	6	22479	22484	0 %	100 %	0 %	0 %	240047153
606	NC_012806	AAG	2	6	22533	22538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047153
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609	NC_012806	CAA	2	6	22605	22610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047153
610	NC_012806	TGC	2	6	22639	22644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240047153
611	NC_012806	ATT	2	6	22711	22716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047153
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613	NC_012806	TAT	2	6	22813	22818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047153
614	NC_012806	A	6	6	22902	22907	100 %	0 %	0 %	0 %	240047154
615	NC_012806	TTG	2	6	22957	22962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047154
616	NC_012806	T	6	6	23001	23006	0 %	100 %	0 %	0 %	240047154
617	NC_012806	A	7	7	23061	23067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_012806	T	8	8	23084	23091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_012806	AG	3	6	23106	23111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_012806	TTTA	2	8	23171	23178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_012806	TAA	2	6	23201	23206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_012806	ATTA	2	8	23207	23214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_012806	TCTT	2	8	23231	23238	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
624	NC_012806	T	6	6	23237	23242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_012806	T	7	7	23261	23267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_012806	A	14	14	23276	23289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_012806	TAATT	2	10	23316	23325	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_012806	T	6	6	23340	23345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_012806	A	6	6	23371	23376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_012806	CAT	2	6	23454	23459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047155
631	NC_012806	ACT	2	6	23503	23508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047155
632	NC_012806	TAG	2	6	23510	23515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047155
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